最近ちょっっとだけ余裕ができたので今後のためにjavascriptを調査中。

prototypeとかjQueryとか便利なライブラリがありますね、ついでに二つのライブラリを同時に使えないかと
思ったら・・・。

ありますね。
とても参考になります。
jQuery 1.1 と他のライブラリ（Prototype, YUI, MooToolsなど）を併用する方法 - のほほん徒然